清华MBA项目作为教育部批准的第一批MBA试点院校，清华MBA项目是中国最具品牌影响力的主流MBA项目之一。共有国际MBA(英文、全日制)、全日制MBA和在职MBA三个子项目。至今已经招收了21届学生，已有8000多人获得MBA学位。

清华MBA项目一直以“根植中国，面向世界”为理念，与时俱进、持续创新。清华MBA培养体系涵盖课程培养与非课程培养两大领域，内容日益丰富完善。MBA学生既能通过精心设计的课程系统学习管理知识，也能通过整合实践项目、企业访问、案例大赛、商业伦理辩论大赛、校友导师计划和海外游学等非课程培养方式培养能力，开拓视野，拓展人脉。

2008年9月，清华经管学院正式推出了“新版清华MBA”，引领了国内MBA教育的变革。新版清华MBA培养方案在高度重视传授知识的同时，更加注重领导者品格培养和能力训练。除了“分析基础”和“管理基础”这两个传统模块之外，新版课程引进了三个全新模块：“软技能”、“中国与世界”及“整合实践”。

这五个模块不仅包括知识的传授，也包括品格和能力的培养;不仅有不同管理领域的管理基础性课程，也有综合运用所学知识的整合性实践课程;不仅有书本知识，也有管理实践。它们一起构成了由“品格”(being)、“知识”(knowing)和“实践”(doing)三个方面组成的完整MBA教育。

为配合MBA课程改革，清华MBA项目2010年进行了招生改革。在录取标准上实行“综合素养考评”，以考察学生的综合素养为主，笔试成绩为辅。在录取方式上率先采取“提前面试国家线录取”的政策，通过申请材料评审和提前面试的考生可以获得“条件录取资格”，然后再参加全国管理类硕士研究生入学联考，成绩达到国家划定的东部院校分数线即获得正式录取资格。MBA招生改革取得了显著效果，录取学生的质量持续提高。